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循證醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建分析

前言:想要寫出一篇引人入勝的文章?我們特意為您整理了循證醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建分析范文,希望能給你帶來靈感和參考,敬請閱讀。

循證醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建分析

材料與方法

一、臨床資料

根據(jù)文獻[2-4]制定CHB的中、西醫(yī)診斷標(biāo)準及中醫(yī)辨證標(biāo)準。根據(jù)研究目的制定了納入標(biāo)準:①符合CHB的診斷標(biāo)準;②有中醫(yī)診斷,有典型“寒”“熱”證候診斷,可兼有“濕”證;③有完整的中藥治療記錄(治療時間為1個月);④單味中藥、中成藥和復(fù)方藥性為“寒”(寒和涼統(tǒng)稱寒)、“熱”(熱和溫統(tǒng)稱熱);⑤年齡18~65歲;⑥性別不限。并制定排除標(biāo)準:①原發(fā)性和/或繼發(fā)性心腦血管、肺、腎、內(nèi)分泌、神經(jīng)和血液系統(tǒng)疾病者;②妊娠、哺乳期婦女;③酗酒、藥物濫用者和依賴者。療效判定標(biāo)準參照《臨床疾病診斷依據(jù)治愈好轉(zhuǎn)標(biāo)準》[5]制定。中醫(yī)證候及主要癥狀療效評價標(biāo)準參照《中藥新藥臨床研究指導(dǎo)原則》[4]制定。查閱我院近十年來采用中醫(yī)或中西醫(yī)結(jié)合治療的慢性乙型肝炎住院病歷,依據(jù)回顧性病例調(diào)查方法,制定一套規(guī)范化的《中藥寒熱性臨床信息采集表》,包括診斷標(biāo)準、納入標(biāo)準、排除標(biāo)準、病例剔出標(biāo)準、患者基本信息、中醫(yī)癥狀采集、中醫(yī)辨病辨證、中藥治療情況、實驗室檢查等。目前已經(jīng)納入符合以上納入標(biāo)準的CHB病例337例,男性273例,女性64例;年齡18~30歲(包括30歲,下同)78例,30~40歲116例,40~50歲86例,50~65歲57例;病程5年以下(包括5年)128例,5~10年153例,10~15年56例。

二、數(shù)據(jù)庫建立方法

數(shù)據(jù)庫采用國際先進的Java2平臺企業(yè)版(Ja-va2PlatformEnterpriseEdition,Java2)技術(shù)體系,采用模型—視圖—控制器(Model-View-Controller,MVC)三層體系架構(gòu),基于Web訪問,支持Win-dows、Linux等多種操作系統(tǒng),支持Oracle、Sqlserver、Mysql等多種數(shù)據(jù)庫,支持中、英文版本,具有安全性高、易擴展、易維護、跨平臺、部署彈性等優(yōu)勢。所有數(shù)據(jù)都保存在數(shù)據(jù)庫服務(wù)器上,所有對數(shù)據(jù)的操作都通過應(yīng)用服務(wù)器進行,從而有利于系統(tǒng)的安裝、維護、更新和數(shù)據(jù)的集中管理,增加了數(shù)據(jù)的安全性。各個數(shù)據(jù)平臺間實現(xiàn)數(shù)據(jù)互聯(lián),信息共享[6-7]。研究單位只需要一個服務(wù)器,各個使用者只需要在電腦使用瀏覽器如InternetExplore,就可以登錄使用。如果將服務(wù)器接入互聯(lián)網(wǎng),還可以實現(xiàn)對系統(tǒng)的遠程訪問,這樣用戶對數(shù)據(jù)的錄入及查詢就不受地域限制,在密碼等授權(quán)的基礎(chǔ)上即可安全進入系統(tǒng)進行數(shù)據(jù)錄入查詢等操作。

1.J2EE技術(shù)體系:典型的J2EE結(jié)構(gòu)如圖1所示。客戶端層主要通過瀏覽器向服務(wù)器提出請求,通過驗證后服務(wù)器返回超文本標(biāo)記語言(HypertextMarkupLanguage,HTML)或Jsp(JavaServerPages)頁面并顯示在瀏覽器上。中間層包括Web服務(wù)器層和應(yīng)用服務(wù)器層。Web服務(wù)器主要是Serviet、Jsp等實現(xiàn)用戶界面,由Wed支持客戶端請求。EJB(EnterpriseJavaBean)組件作為應(yīng)用服務(wù)器層的部署環(huán)境,在EJB容器中部署了分布式計算機中所需要的所有服務(wù),如數(shù)據(jù)庫鏈接及數(shù)據(jù)持久化、分布式事務(wù)管理、組件命名服務(wù)等。數(shù)據(jù)庫層由一個或多個數(shù)據(jù)庫服務(wù)器組成,實現(xiàn)數(shù)據(jù)信息的持久化保持。應(yīng)用層通過Java數(shù)據(jù)庫連接(JavaDataBaseConnectivity,JDBC)與數(shù)據(jù)庫層建立鏈接,保證數(shù)據(jù)的一致性與完整性。J2EE的主要優(yōu)勢在于:①基于J2EE開發(fā)的系統(tǒng)能集成原有信息系統(tǒng),并保證不同系統(tǒng)間的相互操作性;②J2EE的多層結(jié)構(gòu)機制與有效數(shù)據(jù)庫安全技術(shù)保證信息可靠性高;③當(dāng)訪問量增大時,系統(tǒng)可方便地擴展、升級;④易維護,降低了人力維護成本;⑤開發(fā)成本低,開發(fā)周期短;⑥在技術(shù)上具有先進性,能夠為新出現(xiàn)的需求提供系統(tǒng)支持[8-12]。

2.MVC三層體系架構(gòu):MVC設(shè)計模式是“Mod-el-View-Controller”的縮寫,由TrygveReenskaug提出,首先被應(yīng)用在SmallTalk-80環(huán)境中,是許多交互和界面系統(tǒng)的構(gòu)成基礎(chǔ)。MVC分為模型、視圖和控制器3個部分。視圖(View)代表用戶交互界面,模型(Model)就是業(yè)務(wù)流程/狀態(tài)的處理以業(yè)務(wù)規(guī)則的制定,控制器(Controller)為接收用戶請求,將模型與視圖匹配在一起,共同完成用戶的請求。MVC體系結(jié)構(gòu)將傳統(tǒng)的輸入、處理和輸出模型轉(zhuǎn)換為圖形顯示的用戶交互模型,有效地存儲和展示了數(shù)據(jù)的對象,區(qū)分了功能模塊,降低了相互之間的耦合度。由于數(shù)據(jù)和業(yè)務(wù)邏輯分開,在新的數(shù)據(jù)源加入和數(shù)據(jù)顯示變化時,數(shù)據(jù)處理變得更加簡單[13-14]。

三、數(shù)據(jù)庫內(nèi)容

1.患者基本信息:包括患者序列號、患者ID號、姓名、性別、民族、籍貫、常住地、婚況、職業(yè)、飲食嗜好、吸煙史、飲酒史、可能感染方式、家族史、既往其他病史、月經(jīng)史、過敏史、診斷情況、錄入批次、備注等。

2.中醫(yī)癥狀:對入選病例的中醫(yī)癥狀統(tǒng)一管理。數(shù)據(jù)分治療前、治療后兩部分,主要屬性包括乏力、食欲不振、口干口苦、脅痛、皮膚黃染、尿黃、目黃、急躁易怒、善嘆息、情志抑郁、肝區(qū)不適、面色萎黃、面色蒼白或白、面色晦暗、目赤、形體消瘦、身熱、潮熱、畏寒肢冷、失眠多夢、自汗、盜汗、頭重、耳鳴、兩目干澀、頭暈?zāi)垦!⒔⊥?、口淡不渴、口黏膩或口穢、呃逆、胃脘灼熱、厭食油膩、嘈雜、吞酸、胃部滿悶、惡心嘔吐、腹部脹滿、腹痛、腸鳴矢氣、便溏、便下不爽、大便干結(jié)、腰部發(fā)冷、遺精、滑精、陽痿、早泄、尿頻而清、肢體困重、皮膚瘙癢、手足心熱、手足發(fā)冷、關(guān)節(jié)疼痛、腰膝酸軟等一系列中醫(yī)癥狀錄入管理。

3.舌象與脈象:對入選病例舌象與脈象的統(tǒng)一管理。主要包括舌質(zhì)、舌體、舌苔、舌底脈絡(luò)、基本脈象等幾分類信息特征數(shù)據(jù)的收集錄入管理。

4.中醫(yī)辨病、辨證:主要用于將患者證候按中醫(yī)證候分類參考進行分類管理。證候主要包括:濕熱內(nèi)蘊證、濕邪困脾證、肝郁氣滯證、肝郁血瘀證、肝郁脾虛證、脾腎陽虛證、肝腎陰虛證。

5.中藥治療情況:對患者中藥治療情況的收集錄入管理。主要包括:中成藥藥性、用藥情況、中藥復(fù)方藥物初診藥性、初診用藥情況、二診藥物藥性、二診用藥情況、治療后證候判斷等。

6.實驗室檢查:對患者實驗室檢查相關(guān)指標(biāo)的記錄管理,此檢查分為治療前、治療后兩部分供參考對照。主要包括:血常規(guī)、尿常規(guī)、病毒學(xué)、肝腎功能、電解質(zhì)、血脂、血糖、血氨、甲胎蛋白、凝血功能、甲狀腺功能等。

結(jié)果

在制作中藥寒熱藥性循證醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)之前,設(shè)計出一套嚴謹合理,概念明確,數(shù)據(jù)準確,便于量化的《中藥寒熱性臨床信息采集表》,解決了在中醫(yī)證候調(diào)查及中藥治療觀察過程中,存在辨證的主觀性強,受不同醫(yī)師個人經(jīng)驗的影響而出現(xiàn)辨證的不穩(wěn)定性,難以客觀化,從而會影響整體調(diào)查及治療的客觀和準確性的問題。該數(shù)據(jù)庫實現(xiàn)了病歷數(shù)據(jù)分布式網(wǎng)絡(luò)化錄入,實現(xiàn)了病情的圖形化顯示,在線臨床資料統(tǒng)計分析等。支持包括圖片、影像等多種格式的數(shù)據(jù)錄入,具有強大的數(shù)據(jù)查詢、導(dǎo)航、視圖、匯總分析功能。支持功能擴展和結(jié)構(gòu)化定制,能夠滿足醫(yī)學(xué)信息收集與科研過程中的數(shù)據(jù)管理與分析要求,具有完備的數(shù)據(jù)安全與系統(tǒng)備份機制,確保數(shù)據(jù)在采集、傳輸、存貯過程中的完整性、保密性。

1.?dāng)?shù)據(jù)檢索

(1)數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化查詢:創(chuàng)建符合入選標(biāo)準臨床病例數(shù)據(jù)庫表,可以指定任意查詢條件獲取相應(yīng)患者資料信息,如單一中心的病歷檢索,輸入患者序列號或患者ID號或患者姓名,即可檢索到患者基本信息,包括患者常住地、籍貫、工作單位、職業(yè)、血型、婚姻狀況、飲食嗜好、既往病史等信息。點擊查看欄,出現(xiàn)中醫(yī)癥狀、舌象與脈象、中醫(yī)辨病、辨證、中藥治療情況及實驗室檢查工具欄,點擊相應(yīng)工具欄,即出現(xiàn)患者相應(yīng)信息。

(2)靈活快捷的分類導(dǎo)航:通過分類導(dǎo)航我們可以對當(dāng)前頁面信息按分類導(dǎo)航中的字段信息進行自動分類顯示,進而方便有針對性的查詢,分析管理。

(3)全文檢索:采用全文檢索技術(shù),實現(xiàn)對所有患者錄入數(shù)據(jù)的全文檢索功能。

2.?dāng)?shù)據(jù)分析

(1)數(shù)據(jù)匯總分析:能夠按照選擇的列表字段方便快捷地進行各種類型的匯總及制圖(例如:直方圖、餅狀圖、折線圖等)。

(2)支持數(shù)據(jù)挖掘:數(shù)據(jù)挖掘是一種新的信息處理技術(shù),其主要特點是對數(shù)據(jù)庫中的大量數(shù)據(jù)進行抽取、轉(zhuǎn)換、分析和其他模型化處理,并從中提取輔助決策的關(guān)鍵性數(shù)據(jù)。J22E技術(shù)結(jié)合MVC設(shè)計模式在WEB數(shù)據(jù)挖掘應(yīng)用中實現(xiàn),用JSP對應(yīng)于視圖,整個系統(tǒng)主要通過JSP與外界交互服務(wù)器端程序Servelt(Server-Applet)控制邏輯。針對本項目研究目的,主要支持關(guān)聯(lián)分析、聚類及判別分析等。

討論

建立醫(yī)學(xué)信息管理與分析系統(tǒng),可為大規(guī)模結(jié)構(gòu)化病歷收集、流行病學(xué)調(diào)查、數(shù)據(jù)分析等提供統(tǒng)一的數(shù)據(jù)平臺。MVC作為一種典型的軟件體系結(jié)構(gòu),將應(yīng)用分為三層,不僅有利于在代碼修改過程中選取重點,減少代碼復(fù)制和代碼的維護量,提高系統(tǒng)的可維護性、可控制性等性能,而且有利于軟件工程化管理。而J2EE提供中間層集成架構(gòu)來滿足高可用性、高可靠性以及可擴展性的應(yīng)用需求,通過提供統(tǒng)一的開發(fā)平臺,降低了開發(fā)多層次應(yīng)用的復(fù)雜性,同時提高系統(tǒng)復(fù)用性,具有無可比擬的優(yōu)勢。J2EE和MVC融合的體系構(gòu)架將復(fù)雜的業(yè)務(wù)邏輯以EJB組件的形式在服務(wù)器端部署,同時系統(tǒng)的并發(fā)處理能力更強,對復(fù)雜的業(yè)務(wù)管理更加有效。這種事物的集中便于在實施過程中更好地進行安全保護,有效地提高了系統(tǒng)的安全性。在實現(xiàn)過程中,EJB、Servlet、JSP各司其職,既簡化了視圖輸出,又保留了腳本語言的靈活性,從而提高了系統(tǒng)的執(zhí)行性能[13-15]。本項目初步建立以慢性乙型肝炎為研究載體的臨床數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),準確獲取慢性乙型肝炎的流行病學(xué)資料,實現(xiàn)個體資料、臨床資料、相關(guān)醫(yī)學(xué)研究數(shù)據(jù)的信息融合,為中醫(yī)藥治療慢性乙型肝炎的循證醫(yī)學(xué)研究提供結(jié)構(gòu)化、有序化、標(biāo)準化、共享化的管理。大大降低了臨床、科研的工作量,可節(jié)約時間,縮短研究周期。該數(shù)據(jù)庫對進一步的數(shù)據(jù)挖掘,分析慢性乙型肝炎的證候類型、證治特點以及臨床用藥規(guī)律,考察中藥寒熱藥性的生物學(xué)差異和“寒者熱之、熱者寒之”等中醫(yī)治法治則的客觀性提供了科學(xué)基礎(chǔ)。

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