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生物醫(yī)學信號相似性分析方法

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生物醫(yī)學信號相似性分析方法

〔摘要〕隨著醫(yī)學技術不斷發(fā)展,生物醫(yī)學信號逐漸成為醫(yī)學方面的一項重要的診斷技術。由于生物體的復雜性,生物信號還具有隨機性強、信號弱、噪聲強、頻率范圍低、周期性等特點,這導致在相似性分析時面臨很多困難。該文提出了窗口斜率特征提取法,通過確定參數(shù)窗口閾值和網(wǎng)格高度,利用相關公式進行計算,用斜率變化規(guī)律對比相似波形。

〔關鍵詞〕生物醫(yī)學信號;相似性;度量方法;窗口斜率法

生物醫(yī)學信號是由復雜的生命體發(fā)出的不穩(wěn)定的自然信號,可以反映出生物體所處的狀態(tài)及生命情況等,生物醫(yī)學信號不同于其他信號,具有本身的特征和測試方法。通常生物信號包括心電、呼吸、脈搏等,這些信號是生物生命活動的基本屬性[1]。采集生物體內的信號后,可以根據(jù)信號的特征對生物體所處狀態(tài)進行分析和研究,為診斷生物體器官功能并確定治療方法提供可靠的依據(jù)。

1生物體醫(yī)學信號

生物體不同信號的波形圖。幾種常見的心電波形圖如圖2所示,可以看出不同形態(tài)的生物體反映出不同的信號特征,進而反映在波形圖上。醫(yī)師可以根據(jù)波形圖的特征對生物體的病情加以判斷,從而進行針對性治療。計算機和智能化技術的不斷發(fā)展為生物信號診斷技術提供可靠的保證。正確地劃分生物信號類別是醫(yī)學內的重要保證。一般來說,對波形間的相似性程度進行劃分類別,再對不同類別信號加以分析,可以縮短工作量,提高工作效率和分析的準確性,這是目前生物信號研究的發(fā)展方向。

2相似性分析法

指采用某種方法來描述和分析兩者之間的相似度。相似性分析通常分為兩個步驟:特征提取和表示以及相似性度量。由于生物體發(fā)出的生物自然信號能夠隨時間的推移而發(fā)生變化,因此可以把生物信號作為時序信號中的一種。對時序數(shù)據(jù)的分析目前已廣泛應用,例如氣象變化情況、石油勘探情況、股票走勢數(shù)據(jù)等??梢钥闯鰰r序數(shù)據(jù)具有很大的復雜性和計算量,其相似性度量會很大程度影響著分析的結果。生物信號同樣具有上述特性,復雜多變是生物信號波形曲線形態(tài)的主要特征,因此其相似性分析要包括以下兩個方面:一是從原始生物信號中提取特征信息,進行優(yōu)化組合,作為表示特征向量;二是對特征向量進行相似性度量或分類。原始數(shù)列的特征提取對降低計算量有很好的幫助,通過只保留數(shù)列的主要形態(tài),去除次要形態(tài)和細枝末節(jié),提高數(shù)據(jù)分析的準確性。目前,特征提取的方法有很多,研究思路也各不相同。Keogh等[2]以時間序列為基礎,輸出的結果形式為線性分段,這種成為線性分段算法。主要方法是將數(shù)列表示為多段線性的直線,從而減少實驗數(shù)據(jù)。這種線性分段算法的優(yōu)點直觀明了,可進行多解析多運算,支持各類測量方法,應用廣泛。生物信號作為時間序列的一種,也存在復雜表現(xiàn)形式,因此在分析中會面臨很多困難?;€漂移和時間軸的伸縮是生物信號最主要面臨的問題[3-4],選擇合適的距離度量方法,能夠提高相似性分析的準確性。動態(tài)時間彎曲(dynamictimewarp,DTW)可以作為一種有效的解決方法,但它的缺點是時間復雜,應用并不廣泛.

3生物醫(yī)學信號相似性分析的關鍵問題

生物信號作為時序信號的一種,具有維數(shù)高、數(shù)據(jù)量巨大、噪聲干擾嚴重的特點。但由于人體是一個復雜的自然系統(tǒng),人體信號具有時序信號所沒有的一些特點。

3.1隨機性強

由于人體的個體差異性很大,所表現(xiàn)出的生理信號也會隨之產生差異,比如年齡的差異、性別的差異等。人體健康與生病的生理信號,其差異性會更大。生物醫(yī)學信號具有隨機性,它的特征并不平穩(wěn),隨著時間發(fā)生變化,這種變化為醫(yī)學中的信號處理帶來較大困難。

3.2信號弱,噪聲強

一般直接從人體中檢測到的電信號幅值比較小。因此,在處理各種生理信號之前要應用放大器。噪聲是指其他信號對所研究對象信號的干擾,研究時需要對信號去除噪聲再進行研究。

3.3頻率范圍低

經頻譜分析可知,除聲音信號(如心音)頻譜成分較高外,其他電生理信號的頻譜一般較低。

3.4周期性

生物信號的幅值會隨著時間而產生周期性的變化,如圖3所示的心電波形。首先,將連續(xù)信號分為單個波形,即找到電波的最高點為分割點;然后,將連續(xù)波形分為多個單段連續(xù)的波形。若分割點選取不準確,將會對信號的判斷產生影響.生物信號具有維度高、數(shù)據(jù)多等特征,在相似性分析方面存在一定的難度。由于人們大都注意特征數(shù)據(jù)的提取方法,因此希望距離度量采用更簡單的方法。生物信號經過復雜的特征數(shù)據(jù)提取后,距離度量通常采用簡單方法降低運算復雜程度,提高準確率。生物信號具有信號弱、噪聲強、頻率范圍低等特點,需要采用相應方法達到降維、去噪的功能。通常提取初次特征后,剩余的信息量仍然會很大,因此需要對特征數(shù)據(jù)進行再優(yōu)化,采用該方法雖然能保證較高的準確率,但優(yōu)化過程復雜度過高。

4窗口斜率的特征表示方法

特征提取方法是相似性分析的重要內容,是影響分析的效率和精確性的重要保證。由于生物信號波形的相似性,我們需要關注波形中特征點的微小差異,重視波形中的細節(jié)走勢變化,對波形進行分類研究。上文提到,特征提取優(yōu)化過程復雜度很高,難以同時兼顧提取的效率和準確性,但因為生物信號波形具有周期性,可以將波形按照周期進行劃分,波形的變化走勢可以用不同階段內的斜率表示,因此本研究提出了采用窗口斜率的特征表示方法。

4.1窗口斜率表示法

基于X、Y軸的波形圖表示方法。首先將該坐標內的區(qū)域進行網(wǎng)格劃分,網(wǎng)格的大小可由兩個參數(shù):閾值t和網(wǎng)格高度h決定。對橫坐標的劃分網(wǎng)格大小由閾值t確定,對縱坐標的劃分網(wǎng)格大小由網(wǎng)格高度h確定。兩個參數(shù)t和h的大小對窗口效率法分析結果影響較大,對于不同的生物信號波形應選取合適的參數(shù)進行劃分。在網(wǎng)格劃分中,首先設定兩個參數(shù),窗口閾值為t,網(wǎng)格高度為h。則波形的任意一個窗口的幅值可表示為(at(i-1)+1,…,ati+1)。任意一個窗口內的縱向幅值差可以通過公式(3-1)來表示。(3-1)從公式可以看出,當閾值t固定后,公式所計算的值實際就是窗口內的斜率,因此這種方法稱作窗口斜率表示法。

4.2參數(shù)確定

從上述公式的計算方法我們可以看出,窗口斜率特征法的參數(shù)t對于窗口內斜率的計算有著重要的影響,參數(shù)選擇過大,則無法起到精細分析的效果;參數(shù)選擇過小,會導致任務量增加,網(wǎng)格高度一般選擇0.1且不變動。圖5顯示了心電波形和鋒電位波形的形狀,進行兩種心電波形分析時,采用窗口斜率法首先確定閾值和高度。通常,窗口閾值在關鍵波峰的1/10~1/5內選擇,經過大量實驗數(shù)據(jù)表明,心電波形窗口閾值為4時效果最佳,鋒電位波形窗口閾值為2時效果最佳.

4.3窗口斜率法特征提取結果

窗口斜率法的實質就是將坐標內的波形圖進行網(wǎng)格劃分,對網(wǎng)格內的數(shù)據(jù)進行斜率計算,計算結果表現(xiàn)在坐標內,從而對相似的波形區(qū)分開來。生物信號具有復雜性、緯度高等特征,非常適合采用窗口斜率法進行特征提取。在特征提取過程中主要關注窗口內斜率的變化規(guī)律,即使幾個波形走勢非常相似,但反映在斜率變化上會有很大的不同。圖6顯示了3種相似的波形經過窗口斜率法計算后,結果對比差異很明顯。計算前可以看到3種原始波形很難區(qū)分,但通過窗口斜率計算后,特征體現(xiàn)在斜率上會有很大的變化,通過這些變化可以準確判斷波形類別,再進行下一步研究分析。

4.4窗口斜率法特點

窗口斜率特征提取法是基于生物信號復雜性與相似性的難點而定。對3種相似的波形采用窗口斜率法計算后,其斜率波形表現(xiàn)出明顯的差異,因此,窗口斜率法對于生物信號波形的特征提取非常有用,其原理較為簡單,計算方法方便。經窗口斜率法對序列降維計算,能夠節(jié)約計算量。此外,窗口斜率法能夠維持靈敏度和特異度的平衡,使其均保持在較高水平,即在避免異常波形漏檢的情況下,提高了波形識別的準確率。因此,窗口斜率法可作為生物信號相似波形處理的重要手段。然而,窗口斜率法的關鍵點在于選擇合適的閾值參數(shù),它很大程度影響計算的準確性。尋找最優(yōu)閾值是一個煩瑣的工作,需要不斷地迭代計算。窗口斜率法的關鍵點在于窗口閾值的選取,該參數(shù)對斜率計算結果影響很大,而且對不同波形時要求不盡相同。通過手動選取分類閾值,計算結果會有誤差,選不到最優(yōu)閾值,分類結果也得不到最優(yōu)。如果閾值范圍很大,會造成任務量增大,如何選擇確定合適的閾值參數(shù),對于窗口斜率法的應用具有重要影響,這也是下一步工作的主要方向。此外,未來的工作還需要一些實驗結果來論證此方法的效果,通過對不同信號波的研究,確定選擇最佳閾值參數(shù)的方法與理論。

[參考文獻]

[1]劉海龍.生物醫(yī)學信號處理[M].北京:化學工業(yè)出版社,2006.

[2]KeoghE,ChakrabartiK,PazzaniM,etal.DimensionalityReductionforFastSimilaritySearchinLargeTimeSeriesDatabases[J].KnowledgeandInformationSystems,2001,3(3):263-286.

[3]練仕榴,鄭剛,牟善玲.用于心電波形分析的相似性度量策略[J].計算機工程,2011,37(9):263-265.

[4]張大克,王玉杰.隨機平均歐氏距離的統(tǒng)計性質與分類閾值[J].天津科技大學學報,2008,23(4):85-88.

作者:劉彬 馬少華 閆廣宇 單位:安徽省太和縣人民醫(yī)院